Frågan är känslig eftersom Kina länge har ansett att Taiwan är en provins som ska återförenas med fastlandet.
Angela Wilkinson på Lonely Planet säger att de konfiskerade Kinaguiderna är färre än 0,1 procent av alla Kinaguider som har sålts under de senaste tolv månaderna. Hon uppger också att inga guideböcker har konfiskerats i Beijing eller Shanghai. Böckerna har konfiskerats vid den sydöstra gränsen, av resenärer som kommit med tåg och bil.
Lonely Planet har inte heller tagit emot något officiellt uttalande från kinesiska myndigheter.
På sin hemsida uppmanar Lonely Planet resenärer att dölja bokomslaget med inslagspapper eller liknande.
Läs mer på Lonely Planets hemsida
Text: Barbro Janson